企业的申请材料通过中国绿色食品发展中心（以下简称“中心”）认证审核合格后，即进入绿色食品证书颁发程序，颁证程序如下：

    一、通知企业办证

    由中心标志管理处向企业寄发《办证通知》及《绿色食品标志使用许可合同》（以下简称《合同》）等有关办证的文件资料。

    二、办理领证手续

    企业在接到《办证通知》和《合同》（一式三份）后，按照《办证通知》上的要求，在《合同》上签字、盖章，并在3个月内，将《合同》连同设计好的“包装样稿”及《防伪标签订单》等一并返回中心标志管理处，同时将认证费（含申请费、审查许可费、公告费）和第一年标志使用费按照《合同》上确定的数额电汇至中心指定的银行账户，由中心计划财务处核收，并开具发票。

    三、编号制证

    标志管理处在收到上述文件后即进行统一编号，为许可使用绿色食品标志的企业和产品编排“企业信息码”和“产品标志编号”，并负责制作《绿色食品证书》（以下简称《证书》）。

    四、签发《证书》

    标志管理处完成绿色食品证书制作后，将《证书》和《合同》一并报送中心主任签发。

    五、核发《证书》

    标志管理处在核实企业完成办证手续，缴纳有关费用后，于 10个工作日内将中心主任签发的《证书》及《合同》（一份）寄送企业，或所在地绿办（中心），同时将《证书》（复印件）、《合同》（一份）抄送绿办（中心）。  

    六、发布公告

    根据《绿色食品标志管理公告通报实施办法》的规定，通过有关媒体，中心对获得绿色食品证书的企业和产品予以公告。